Chương trình Flagship tại VCVAA là chương trình giáo dục nghệ thuật thị giác đương đại đầu tiên và duy nhất tại Việt Nam dành cho Học viên từ 2 đến 18 tuổi. Chương trình được thiết kế với lộ trình giáo dục theo định hướng dài hạn, được chia thành các giai đoạn phát triển phù hợp với từng độ tuổi và khả năng của Học viên. Với sự phát triển theo lộ trình từ Cảm Nhận, Khai Phá, Nền Tảng và Nâng Cao, chương trình không chỉ tập trung vào việc khai phóng và phát triển năng khiếu nghệ thuật từ sớm mà còn xây dựng nền tảng vững chắc rèn luyện tư duy sáng tạo cho Học viên.